Universitas Darunnajah berdiri pada tanggal 3 Agustus 1986, dengan nama Ma’had ‘Aly, dengan spesialisasi (jurusan) Syari’ah. Program tersebut awalnya dibangun untuk para alumni Pondok Pesantren Darunnajah agar bisa melanjutkan serta memperdalam pengetahuan di bidang kajian syari’ah.
Seiring dengan ketentuan sistem pendidikan nasional, nama tersebut kemudian berganti Sekolah Tinggi Ilmu Syari’ah (STIS) Darunnajah, yang sebelumnya pernah bernama Institut Agama Islam Darunnajah (IAID).
Dengan perkembangan minat calon mahasiswa baru yang saat itu tidak hanya berasal dari alumni Pondok Pesantren Darunnajah, STIS Darunnajah membuka jurusan baru yaitu Pendidikan Bahasa Arab dan Kependidikan Islam, yang secara otomatis STIS Darunnajah berganti nama Sekolah Tinggi Agama Islam (STAI) Darunnajah.
STAI Darunnajah dipersiapkan untuk mengembangkan kualitas sumber daya manusia (SDM) pada tingkat universitas yang mampu menjawab tantangan global di era teknologi informasi, serta perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi modern yang tetap berpegang kepada prinsip-prinsip dasar agama.
Alumninya tersebar di seluruh Indonesia, diantara alumni ada yang melanjutkan pendidikannya di dalam negeri dan ada juga melanjutkan pendidikannya ke luar negeri seperti Arab Saudi, Mesir, Turki, Pakistan, Maroko, Malaysia, Singapura, Jepang, Australia, Amerika, Inggris,
Sejak tahun 2000 hingga 2021, Yayasan Darunnajah sudah memiliki 3 Sekolah Tinggi, yaitu STAI Darunnajah Jakarta, STAI Darunnajah Bobor, dan STIE Darunnajah Jakarta.
Pada tanggal 22 Juni 2022, Yayasan Darunnajah resmi menerima SK Pendirian Universitas yang diterbitkan oleh kemdikbudristek yang diserahkan melalui LLDIKTI III.
Universitas Darunnajah hingga saat ini telah membuka 10 Program Studi dinaungi oleh 3 Fakultas :
A. Fakultas Agama Islam
1). Program Studi Hukum Keluarga Islam,
2). Program Studi Manajemen Pendidikan Islam,
3). Program Studi Pendidikan Islam Anak Usia Dini, dan
4). Program Studi Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah
B. Fakultas Bisnis
1). Program Studi Administrasi Bisni,
2). Program Studi Bisnis Digital,dan
3). Program Studi Kewirausahaan.
C. Fakultas Sains & Teknologi
1). Program Studi Rekayasa Perangkat Lunak
2). Program Studi Sistem & Teknologi Informasi, dan
3). Program Studi Sains Aktuaria
INSTITUSI
HKI
MPI
PIAUD
INSTITUSI
SK Pendirian Institusi : Nomor 081/YDN/VIII/1986 / 3 Agustus 1986
Pejabat yang Menerbitkan SK : Ketua Umum Yayasan Darunnajah
Izin Operasional : Nomor 18 Tahun 1987, tanggal 29 April 1987
Pejabat yang menandatangani : Rektor IAIN Syarif Hidayatullah Jakarta
(Koordinator PTAIS /KOPERTAIS Wil. I Jakarta) Drs. H. Ahmad Sjadali
HKI
Program Studi : Hukum Keluarga (Al-Ahwal Al-Syakhshiyah)
SK Pendirian Program Studi : Dj.II/115/2005/10 Mei 2005
Pejabat yang Menerbitkan SK : Dirjen Bagais Depag RI
Akreditasi : BAN PT: No. 11448/SK/BAN-PT/Akred/S/X/2021
Nilai Akreditasi : Baik
MPI
Nama Program Studi : Manajemen Pendidikan Islam (MPI)
SK Pendirian Program Studi : Dj.I/216.C/2007/28 Mei 2007
Pejabat yang Menerbitkan SK : Dirjen Pendis Depag RI
Akreditasi : BAN PT: No. 656/SK/BANPT/Akred/S/IV/2019
Nilai Akreditasi : Baik
PIAUD
Nama Program Studi : Pendidikan Islam Anak Usia Dini (PIAUD)
SK Pendirian Program Studi : No. 3656 Tahun 2014/ 01 Juli 2014
Pejabat yang Menerbitkan SK : Dirjen Pendis Depag RI
Akreditasi : BAN PT No. 1471/SK/BANPT/Akred/S/V/2019
Terakreditasi (C)